朱见深孩子众多，一生中有十四个儿子，六个女儿。

长子是由万贵妃所生，出生于成化二年，还未为其取名便已夭折。

次子朱佑极，贤妃柏氏所生，出生于成化五年，两岁时被立为太子，成化八年夭折，谥号悼恭太子。

三子朱佑樘，出生于成化六年，是宫女纪氏所生，也就是后来的明孝宗。

四子朱佑杬，出生于成化十二年，嫔妃邵氏所生，后因明武宗朱厚照驾崩，因无子嗣，根据《皇明祖训》“兄终弟及”原则，朱厚熜以武宗堂弟身份继承皇位，即嘉靖帝，嘉靖即位不久后，便在长达三年的商议中。

杨廷和等大臣认为，朱厚熜应先过继到孝宗名下，以孝宗为皇考，才能继承大统，但朱厚熜认为遗诏是让他来当皇帝，而不是当皇子，他想追尊自己的生父朱佑杬为皇帝。

最终嘉靖帝获胜，他不顾群臣反对，追尊生父朱佑杬为“兴献帝”，后又加封为“献皇帝”，并追谥为“知天守道洪德渊仁宽穆纯圣恭俭敬文献皇帝”，庙号睿宗，牌位升祔太庙，排序在明武宗之上，最终为其父追赠为睿宗献皇帝。

五子朱佑棆，出生于成化十四年，嫔妃邵氏所生，被封为岐惠王。

六子朱佑槟，出生于成化十五年，庄懿德妃张氏所生，被封为益端王。

七子朱佑楎，出生于成化十五年，德妃张氏所生，被封为衡恭王。

八子朱佑枟，出生于成化十七年，嫔妃邵氏所生，被封为雍靖王。

九子朱佑榰，出生于成化十七年，妃姚氏所生，被封为寿定王。

第十子，出生于成化十九年，还未取名就夭折了，他是王敬妃所生。

十一子朱佑梈，出生于成化二十年，德妃张氏所生，被封为汝安王。

十二子朱佑橓，出生于成化二十一年，恭妃杨氏所生，被封为泾简王。